就算是同人作品，也是相當有水準！請慢慢欣賞~
曉之玄武浮出水面
3年後曉重磅登場，曉首領欲派出鼬誅殺叛徒大蛇丸，而鼬不知因為什麼理由推辭了， 所以曉首領通知玄武下手。另一頭大蛇正在準備轉生之時，被帶著面具的玄武
狙擊，戰鬥中大蛇擊落玄武面具，面具下赫然是兜，兜說他潛伏在大蛇身邊這麼多年只是為了學到不老不死之術，如今大功告成而首領又正好下令。大蛇重傷之下抓住佐助逃走後準備強行轉生。侵蝕佐靈魂時，鼬忽然出現，用月讀使大蛇意志力銳減，靈魂反而被佐吞噬。而佐一直昏迷，並未看到鼬的出現。
卡凱西潛力全開
卡凱西依舊放心不下佐，於是擅離木葉前往音忍營救佐，正好碰上正在清理大蛇殘餘勢力的兜，卡卡質問兜佐的去向，而兜亦對木葉第一技師卡卡的實力很有興趣，於是兩人發生戰鬥。兜真正的實力令卡卡完全落在下風，昏迷中卡卡想起了帶土，後忽然撕開面罩，遮住了寫輪眼，說一直以來自己都是使用寫輪眼來代替已死去的帶土做戰，而如今要使出屬於自己的力量。兜依然對卡卡不屑一故，認為沒有寫輪眼的卡卡完全沒有資格同自己戰鬥。卡卡說要用完成版的雷切讓兜以及曉見識下木葉白牙的兒子真正的實力。
玉女的出現
全力全開的卡凱西和藥師兜在戰鬥中打得難分難解。為了保衛學生的卡凱西顯然更加強過藥師兜。就在卡凱西準備擊殺藥師兜的時候，和藥師兜一起行動的玉女出手阻止了卡凱西。玉女警告藥師兜他們的任務只是殺死大蛇丸，現在任務完成已經沒有必要再久留了。卡凱西當然不肯放過這個機會，但是玉女發出沖天的殺氣警告卡凱西如果不識相的話只有殺了卡凱西了。被玉女實力鎮住的卡凱西一時竟然動彈不得，只能目送藥師兜和玉女消失。不久，得知卡凱西行動的自來也和漩渦鳴人趕到帶走了昏迷的佐助。
宇智波一族的故事
鼬離開戰鬥後，“曉”的另一個成員北斗問鼬為什麼要救佐助。鼬回答說因為佐助才是一族裏面潛力最強的人，只有佐助才有希望達到他和北斗都不可能達到的寫輪眼的最高境界----以團扇之血喚醒沉睡在佐助體內的宇智波一族的聖獸“朱雀”！接著鼬憤怒的指出當年滅族一事就是“北斗”，這個4代火影的同學第2次忍界大戰的傳奇人物也是第一個發現萬花筒寫輪眼的---宇智波炎金所操作！可是北斗表示他這樣做這是為了讓宇智波一族的精英分子遵循先代宇智波的願望：追求絕對強勁之路！並表示過於和平的生活已經讓宇智波一族沒落了。同時“北斗”認為宇智波鼬殲滅了全族就是證明鼬的內心也是認同他的想法！鼬表示自己無法打敗北斗，但是他留下佐助的目的就是讓佐助親手來消滅他和北斗！
雙重間諜
玉女和藥師兜複命之後，玉女提出要暫時脫離組織。因為玉女發現了非常感興趣的東西要獨立研究。這時岩之國逃忍三台（第一部的豬籠草）提出如果玉女一再無視組織自己行動的話，就會和大蛇丸一樣的下場。玉女說如果三台覺得自己有實力的話隨時可以來挑戰。這時藥師兜說玉女是個很可怕的人，除了組織領袖沒人知道玉女的面貌和來歷。玉女離開組織一路趕路，在瀑布處遇到了自來也。玉女拿下了臉上的面具，竟然是靜音！！靜音告訴自來也曉的首領要她監視鳴人的時間就要到了，曉組織準備來奪取九尾了。自來也表示靜音很辛苦了，但靜音表示這樣做是為了報父親被殺之仇。
九尾的故事
自來也晚上暗會綱手。他告訴了綱手當時在第2次忍界大戰的時候，木葉為了取得戰術上的優勢，進行了一個名叫“日出”的通靈禁術開發計畫。當時的負責人除了大蛇丸還有一個人就是3代火影的兒子猿飛心之助。沒想到計畫還沒結束戰爭就結束了，眼看計畫就要成功的猿飛心之助不甘心，繼續禁術的研究。同時這項計畫也得到了風之國的暗中支援，不久在沙忍村的活體實驗成功！心之助非常興奮決定在火之國進行同樣的活體實驗。鳴人這個用木葉村各位精英忍者DNA製造出來的最完美的容器誕生了，結果因為妖獸力量太強，實驗失敗導致了16年前的九尾事件。而猿飛心之助也在實驗失敗後，殺死了阻止他的靜音的爸爸下落不明！他也就是“曉”的領袖青龍。現在經過10多年的準備後心之助禁術已經完善，而“曉”組織也準備用奪來的各國妖獸徹底消滅現在的世界格局，建立他們所希望的世界。
木葉的背叛者
藥師兜和靜音再次出現在木葉，這次曉的領袖要他們奪回九尾。入夜，藥師兜並沒有按計劃行動，靜音很奇怪，兜說有人會吧九尾帶給他們。突然自來也帶著混睡的鳴人出現！原來自來也才是心之助在木葉安插的臥底，九尾容器的培養就是由自來也負責，自來也的代號就是“曉”之第十人滕蛇！現在任務已經完成，自來也要回組織，同時要以“背叛”木葉的罪名殺掉靜音這個曉的叛徒。這時綱手突然出現，責問自來也為什麼要這樣做。自來也認為分裂的5國就是戰爭的原因，只有心之助忍界大同才能永遠結束戰爭，所以自己會幫助心之助。自來也表示看在過去的情份上曉絕對不會進攻木葉，自己也不想殺綱手，但是綱手絕對不要干涉他們！綱手認為心之助的計畫只能代來世界的毀滅一定要阻止，並表示為了木葉自己會打倒自來也。於是自來也，兜和綱手，靜音交戰！危機時刻，卡凱西和阿凱趕到，但是曉的另外2個成員北斗和朱雀出現了，戰況非常艱難，靜音和凱先後身受重傷！
佐助和咒印
佐助回來以後因為靈魂被大蛇丸侵蝕了部分加上咒印的影響一度精神很不穩定。自己甚至責怪木葉不該把他帶回來，因為這樣自己無法變強。但是春野櫻一直在照顧和鼓勵佐助，小櫻說自己一個人孤獨的話根本不能變強，和夥伴們在一起才是真正的變強之路。並表示這次就由她來幫助佐助克服咒印的力量。佐助為了克服咒印一次又一次進行特訓，也一次又一次迷失在黑暗之中，但是每一次都被小櫻喚醒。漸漸地佐助又變回了很久以前那個開朗的佐助！在特訓中佐助開始和自己體內的聖獸朱雀對話，佐助表示自己一定會馴服朱雀。
就在又一次和春野櫻特訓回家的路上，佐助和小櫻遇見了和曉成員苦戰的5代火影等人！佐助決定這次自己來保護鳴人。可是在北斗和鼬壓倒性的實力面前佐助被打敗了，北斗告訴佐助只有獨自一人追求強大之路才是宇智波一族強大的動力。這次佐助沒有動搖，他認為自己已經找到了最重要的人了，如果離開他們自己的強大毫無用處。可是佐助又一次打倒了，同時為了保護他，櫻也被鼬砍到。鼬同時繼續嘲笑佐助的無用，這是在大蛇丸殘留意識的影響之下，陷入黑暗意識中佐助開始懷疑自己，但是小櫻突然出現鼓勵他絕對不要放棄之前的努力，接著鳴人也出現嘲笑佐助半途而廢，然後是卡凱西老師。。。。。。。。。。黑暗中的佐助突然發現了一條光明之路，在路上的都是自己的夥伴，而在人群深處似乎也有鼬的身影，終於聖獸朱雀覺醒了！北斗準備在朱雀沒有完全發揮力量的時候搶奪朱雀。為了阻止他鼬犧牲了自己，臨死前鼬告訴佐助自己的罪已經還清了，自己一直愛著佐助。
意想不到的援軍：
鼬戰死，北斗重傷，雖然因為朱雀的力量太大佐助昏迷了。但是在綱手等人的努力作戰之下，自來也他們放棄了搶奪朱雀的計畫，不得不撤退。當然用鳴人做為人質要脅，他們的撤退還算順利。幾天後佐助醒來，卡凱西告訴他鳴人已經被抓走了。佐助打算一個人去救鳴人，被綱手制止了。綱手說事關重大，已經通知了其他4國，並準備聯合行動打擊曉。這時，全身忍術盡失的大蛇丸找到綱手，要求綱手為他治好雙手，條件是透露他所知道的全部曉的機密！綱手猶豫了很久，決定同意大蛇丸的條件，但是大蛇丸必須被木葉嚴密監視。
風之國的變故：
曉組織的白虎沙之叛忍服部才藏和猿飛心之助決定奪取我愛羅體內的守鶴，因為我愛羅是90%成功的人體標本。在沙之國他們的行動一度非常順利。但是最後在就要把守鶴和我愛羅剝離的時候，木葉派去沙國的使者鹿丸和其他沙忍趕到了。為了順利脫身，心之助釋放了部分守鶴的力量來吞噬沒有完全剝離的我愛羅的靈魂！我愛羅被守鶴控制前要求手鞠和堪九郎殺了自己封印守鶴，但是手鞠和堪九郎無論如何也做不到！在猶豫的時候守鶴覺醒。這時鹿丸發覺曉操作妖獸的時候必須以容器的靈魂在妖獸體內作為靈媒控制妖獸，而自己通過控制靈媒控制妖獸。現在我愛羅的部分靈魂被曉所控制，而另部分靈魂和守鶴合體。如果解除曉成員的控制，和守鶴合體的我愛羅沒准可以蘇醒。可是青龍和白虎的力量太強了，而且還有守鶴的幫忙。沙忍們傷亡慘重，到最後鹿丸他們還是棋差一招，關鍵時刻堪九郎以犧牲自我的同歸戰術擊敗了白虎。堪九郎說這個是他這個做哥哥的第一次也是最後一次幫助我愛羅了。堪九郎的死再次刺激了我愛羅，守鶴的力量被控制了。猿飛心之助只能撤退。
鳴人的故事：
在曉的基地鳴人醒了過來。搞清狀況以後他責問自來也為什麼要這樣做。自來也告訴鳴人：他培養鳴人本來就是為了實現曉的理想，鳴人存在的意義就是成為九尾的容器，鳴人並不是什麼廢才，而是融合了許多優秀忍者--包括4代火影的基因製作出來的優秀容器。鳴人本身的強大力量就是用來接納九尾的。自來也告訴鳴人力量用在有意義的道路上才能發揮作用！鳴人反駁自來也說：保護最重要的人就是有意義的道路！只有這樣才會強大。自來也說：現在的鳴人連自己都保護不了又怎麼能保護別人。只有安心成為九尾的容器才能獲得強大。但是鳴人說自己絕對不會違背自己的忍道。這時心之助出現告訴鳴人：固執的保護一村，一國，不合理的利用力量就是3代火影的失敗之處。並表示他會用忍界大同的道路來證明自己父親3代火影的無能。鳴人認為自來也和心之助都錯誤的理解了3代火影，和3代火影比他們都是垃圾！交涉破裂！曉決定用九尾來侵佔大部分鳴人的靈魂，只保留最少的部分來作為靈媒的控制。
忍術天才：
大蛇丸的身體被綱手治好了。但是大蛇丸發現：自己再也不能製造任何查克拉了。發動不了任何忍術，對忍術奇才大蛇丸來說無疑是最大的嘲笑。大蛇丸仍然不放棄自己研究忍術的決心。他親自找到佐助，要求毫無保留的教佐助自己畢身的忍術知識，讓佐助作為自己的信念的延續繼續研究世間的忍術。佐助準備拒絕大蛇丸的要求，但是春野櫻認為佐助可以接受大蛇丸的要求，不過佐助會按自己的想法研究和使用忍術---保護最重要的人。而且小櫻保證自己可以幫助佐助不會因為繼承大蛇丸的信念而放棄夥伴！！！！就這樣佐助同意了大蛇丸要求。綱手看到後向大蛇丸承認春野櫻有能力作到自己當年沒有做到的事情。大蛇丸則認為忍術之路只要孤獨一人就可以了！綱手則說大蛇丸現在是口是心非。
道不同不為謀：
深夜，3個身影站在歷代火影雕像前面行禮。月光之下發現他們就是：自來也，宇智波炎金和猿飛心之助。等他們行完禮後，綱手和一干上忍出現責問他們為什麼要來木葉。3人表示他們這次來木葉絕對沒有任何戰鬥的想法，而且因為想和綱手交涉才故意被他們發現。綱手說自己不會和木葉的叛徒交易，他們3人也不配給火影行禮。3人表示：即使是現在他們也仍然認為自己是木葉的忍者，但是他們的忍道和木葉大多數人的迂腐忍道不同。剛剛他們是向木葉行最後一個君臣之禮，從現在起任何要阻擋他們忍道的障礙都要拔除---即使是木葉也不例外。現在木葉如果不想捲入戰爭的話就不要再和4國聯盟，也不要再和他們為敵了。作為他們的故鄉--曉不會向木葉下手！話畢，3人要離開，綱手命令木葉忍者讓他們走。夜色中的綱手一臉嚴肅！此時曉基地的鳴人正在自己意識中和九尾戰鬥！
此為第2部前部線索，我們的漩渦鳴人將要如何應對呢！？